Sie steht auf einer großen Terrasse, auf der Oberseite des Bonistallo Hügels, mit einer neunzehnten Jahrhundert Veranda voraus (im Jahr 1793 neu gemacht), die viele Grabsteine ​​beherbergt. Die Kirche hat ein einziges Schiff, von einem flachen Tonnengewölbe bedeckt, sie verfügt über ein achtzehnten Jahrhundert Interieur mit Gemälden des XVII-XVIII Jahrhunderts (Matteo Rosselli, Bereich von Bilivert, Fra Felice da Sambuca). Im hinteren Teil des Gebäudes befinden sich die Sakristei und die Räume der ehemaligen Kompanie. Die Kirche wurde Ende des 16. Jahrhunderts als Oratorium der Gesellschaft von San Francesco Stigmata erbaut und 1760-80 in ihrer heutigen Form vollständig restauriert.
Um die Kirche kümmerten sich besonders die Großherzöge der Toskana, denen die Medici Villa von Poggio a Caiano in der Nähe gehörte. In der alten Kirche Santa Maria Assunta in Bonistallo wurden „in vier Krügen“ die Eingeweide von Francesco I. de Medici und Bianca Cappello begraben, die in der Villa starben, deren Entdeckung sie auf ihre Arsenvergiftung verdächtigte; eine Hypothese, die aus späteren wissenschaftlichen Studien noch nicht bestätigt wurde.